1980年代，余儀呈還是榮總家庭醫師科的住院醫師時，就對醫療制度改革特別關心。那時他就深切體認到，健保給付制度關係到健保是否能走向正軌，所以借了許多公共衛生的書籍研究。他回憶道：「我在當住院醫師時，借這一類的書（醫療體系制度）特別頻繁，都是沒人要看的書，都在講醫療制度或健保支付改革。因為我發覺體制不改革，醫師的行為就是這樣，社會終有一天會把我們看成蒼蠅。」
1982年，他擔任榮總家庭醫學科主治醫師，衛生署委託幾個醫學中心輔導全台幾個醫療資源不足的地區。余儀呈被分派到宜蘭地區醫療網的建設計畫，因此開始對社區醫學有進一步的涉獵。他說：「那個年代我就在做社區醫學，輔導宜蘭縣十二個衛生所；每個衛生所在做公共衛生事務，我參與輔導時就告訴他們，要以一種群體切豆腐分配資源的方式，切得好、分配得好的話，每個人都很滿意。1990年到1994年全榮總出差最多的醫師大概就是我吧，一個星期至少要跑一次宜蘭。」
累積了醫療改革的知識與社區醫學的經驗後，1995年余儀呈離開榮總，本著人性照護的理念自行開設家庭醫師診所，「我的概念就是家庭醫師的概念：家庭醫師的專長在預防、社區與醫病溝通，不是靠醫療設備，而是靠人的關懷、靠對病人的瞭解。不要小看這個，同樣是肚子痛，我瞭解這病人過去很多體質的狀況，看診的內容就是不一樣，這都是家庭醫師的特色，清楚病人的脈絡，也知道預防該怎麼做，已發生的健康問題該如何管理。這也是為甚麼我認為家庭醫師最適合擔當論人計酬的責任醫師。」
他預計如果使用資訊管理工具，一個家庭醫師可以照顧三千位民眾，這個規模在論人計酬應達到一年500萬元的收入，如此才能吸引其他醫生轉變醫療型態。為了達到有效管理家庭會員，余儀呈2003年開始去資策會學寫電腦程式，後來與百略醫學科技公司合作，花了四年時間研發國內外第一個匿名機制的健康管理系統HealthMi。透過這個系統平台，民眾擁有一個自己的個人健康紀錄，可以授權家庭醫師在醫生端可以看到私人資料；在網站端不會顯示任何的個人身分，但個人可以根據自己的設定看到自我健康資料。這樣一來，一個醫生照顧三千個會員不是夢想。明年1月起，陽明醫院醫療群診所將嘗試採用此系統管理病患，將來芝山生活家的生活紀錄也將會使用這個系統。
從家庭醫學到社區醫學，再到創立醫療網路平台，余儀呈為論人計酬準備好了每一步。這些理想勢必在芝山生活家的施行下，得到民眾健康的甜美果實。未來健保是否能合理化並達成使人健康的目的，且讓大家拭目以待。
